船只的选择直接影响战斗胜负。根据船只改装、技术及武将水军适性的综合搭配，优先选择能强化队伍核心战术的船只类型。肉队适合接舷技术增强减伤，速攻队依赖渡江技术抢占先手，而资源型玩家可侧重掠敌技术以战养战。不同改装如神行、坚韧、善水等需结合队伍定位灵活切换，同时武将操练提升水军适性也是关键。
非吴国阵营因水军适性普遍较低，前期建议选择善水改装临时提升一级适性，而吴国队伍可直接选用坚守或孤军强化野战能力。神行改装适合中后期大规模调动，坚韧则能降低攻城体力消耗，是器械队破关的首选。强攻改装专门针对连舫效果，在特定战术中能发挥奇效。需注意每次改装需消耗1000战法点且48小时内无法重复调整，因此决策需谨慎。
船只技术的优先级取决于队伍定位和战场阶段。掠敌技术在前中期资源紧张时性价比极高，能通过战斗获取额外资源；焚舟技术对连舫目标有额外伤害加成，适合攻坚型队伍；接舷技术提供全程减伤，是拖回合阵容（如太尉盾、吴枪）的理想选择。巡航技术为挂机玩家提供便利，但可能被针对性克制；渡江技术的先攻效果虽实用，但需与队伍自带先攻战法或兵书协调，避免属性浪费。
通过战斗或拆除耐久获取操练点，可将低水军适性武将逐步提升至A级甚至S级，打破吴国武将的垄断优势。例如司马懿等陆战强将经操练后也能在水战中发挥实力。需注意操练仅对实际参战武将生效，且前期建议优先将主力武将练至A级适性，再逐步追求S级以节省资源。
前期优先掠敌积累资源，中期根据同盟战略选择焚舟或接舷强化主力，后期则侧重神行改装提升机动性。驻守水军营地的队伍推荐坚守改装，而隐身偷袭战术可搭配渡江技术实现战术突袭。迁城至水上需权衡资源收益与战略价值，通常陆地迁城更利于长期发展。
严谨的战术规划与灵活的实时调整是水战胜负的决定性因素。
